Du fait de leur compétence en matière d'assainissement, les collectivités sont responsables des boues produites dans leurs stations d'épuration et prennent en charge leurs exutoires. La filière des boues, qui inclut traitement et valorisation, doit être adaptée aux moyens et au profil des collectivités. Certaines auront parfois intérêt à envisager leur gestion à une échelle plus large du territoire, afin de trouver des solutions pérennes. Les traitements des boues les stabilisent et réduisent leur volume. Leur choix découle de la voie de valorisation envisagée : épandage, incinération ou enfouissement. Si le retour au sol reste actuellement majoritaire, la tendance est d'intégrer une valorisation énergétique intermédiaire. Car les boues constituent également un concentré d'énergie valorisable sous forme de biogaz. La réglementation en place rend désormais possible l'injection du biométhane dans le réseau de gaz naturel et incite au développement de la méthanisation.